MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Synechococcus sp. PCC 6312 plasmid pSYN6312.01

Total Repeats: 51

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019681	A	6	6	23	28	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019681	ATTTTA	2	12	1738	1749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019681	CAGT	2	8	2353	2360	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_019681	ACC	2	6	2841	2846	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_019681	TCAA	2	8	2869	2876	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_019681	CATCCC	2	12	2917	2928	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_019681	ATTT	2	8	3262	3269	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019681	T	7	7	3387	3393	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019681	GAT	2	6	5356	5361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019681	AC	3	6	5425	5430	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_019681	CTG	2	6	5706	5711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_019681	GTCA	2	8	5733	5740	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_019681	ATGAC	2	10	6332	6341	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
14	NC_019681	CAC	2	6	6783	6788	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_019681	ATC	2	6	6828	6833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_019681	AT	3	6	6938	6943	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019681	TCT	2	6	6961	6966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_019681	CTT	2	6	8606	8611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_019681	GGGA	2	8	8671	8678	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019681	CTA	2	6	8802	8807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_019681	GCA	2	6	8865	8870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_019681	GAATTA	2	12	8885	8896	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019681	TGTC	2	8	8897	8904	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_019681	TTCT	2	8	9391	9398	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_019681	CTG	2	6	9434	9439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_019681	ATG	3	9	9441	9449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019681	AAT	2	6	9450	9455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019681	TCG	2	6	9456	9461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_019681	CTT	2	6	9488	9493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_019681	G	7	7	9524	9530	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019681	GCG	2	6	9545	9550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_019681	G	6	6	9564	9569	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019681	ACT	2	6	12114	12119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_019681	TTTTC	2	10	12122	12131	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_019681	TTGG	2	8	12421	12428	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019681	CAAT	2	8	13224	13231	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_019681	ATT	2	6	14965	14970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019681	GA	4	8	15004	15011	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019681	AG	3	6	15472	15477	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019681	CT	4	8	15508	15515	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_019681	TAT	2	6	15521	15526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019681	ATTG	2	8	15548	15555	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019681	AAT	2	6	15556	15561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019681	TA	3	6	15589	15594	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019681	GAAA	2	8	16781	16788	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019681	A	8	8	16786	16793	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019681	GA	3	6	16833	16838	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019681	T	6	6	17724	17729	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019681	A	6	6	17747	17752	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019681	AATT	2	8	17833	17840	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019681	GC	3	6	17948	17953	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.